Erzincan’daki kumpas davası başta olmak üzere Türk Silahlı Kuvvetlerini hedef alan FETÖ/PDY kumpaslarına karşı duruşuyla simgeleşmiş kıymetli bir komutandır. 3. Ordu Komutanlığı görevini yürüttüğü dönemde “Erzincan Ergenekon Davası” kapsamında 1 numaralı şüpheli yapılarak hakkında yakalama kararı çıkarılmış, ancak bu hukuk dışı davayı ve mahkemeyi tanımayarak duruşmalara katılmamıştır. Hedef gösterilmesine ve üzerindeki ağır psikolojik baskılara rağmen görevini aksatmadan sürdüren Berk, bu dik duruşuyla kumpas davalarının meşruiyetini kamuoyu nezdinde sorgulatan ilk ve en güçlü tavırlardan birini koymuştur. Yargıtay’daki nihai yargılamada tüm suçlamalardan beraat ederek aklanmış, bu mücadele Türk hukuk ve askerlik tarihine gayrimeşru yapılara karşı sergilenen onurlu bir direniş örneği olarak geçmiştir.